2008年1月24日 星期四

galectin phylogenetics tree

可以看出Galectin-8與其他galectin members的親緣性較遠

Galectin-1 open reading frame

利用 NCBI ORFinder找出Galectin-1的基因序列中open reading frame的區域

Galectin-1 protein sequence 與 structure




Galectin-1 蛋白質3級結構的形成,是藉由胺基酸序列之間輕鍵與凡德瓦力的作用而形成14 KD 的蛋白質。


Protein: EAW60178

2008年1月23日 星期三

galectin family pretty

http://stweb.cgu.edu.tw/~b9309005/TLR/galectin.pretty

藉由pretty的結果,可以比較galectin family中不同的galectin gene中的consense sequence的比較

galectin-1 phylogenetics


藉由比較不同物種的galectin-1可以知道其他物種於人類galectin-1的相似程度,經過分析過後可以知道與人類最相近的是rhesus monkey,第二相近的則是house mouse

galectin-1 pileup




由於pileup出來的檔案太大,因此藉由上面網址即可以下載galectin-1 seqence比較的結果
可以明顯的看出human和monkey的序列是比較相近的

Galectin family pileup


將以找到的galectin family gene 做 pileup,藉此比較不同的galectin 的基因序列